Phantasy Star II é um RPG de turnos lançado para o Mega Drive/Genesis, sendo um dos primeiros grandes títulos do gênero em 16 bits. A história se passa no sistema estelar Algol, onde Rolf, um agente do governo, investiga estranhos acontecimentos ligados ao sistema de controle climático Mother Brain.

Diferente dos anteriores, mistura fantasia medieval com ficção científica e se passa na nave-mundo Alisa III. O jogo introduz um sistema inédito de gerações, onde o protagonista inicial, Rhys, pode escolher com quem se casar, definindo quem serão seus descendentes e o rumo da história. Essa mecânica garante múltiplos caminhos narrativos e finais diferentes.

O jogo se passa no sistema solar de Algol, mil anos após os eventos de Phantasy Star II. O protagonista Chaz Ashley, um jovem caçador, e sua mentora Alys Brangwin enfrentam uma nova ameaça biológica e tecnológica que ameaça todo o sistema.

O jogador assume o papel de Max, um jovem guerreiro escolhido para liderar o exército de Guardiana contra as forças malignas de Runefaust. A narrativa se desenrola em um mundo de fantasia medieval, com castelos, magias e criaturas míticas.